尼爾斯（小山茉美 配音）是個(gè)調(diào)皮搗蛋的小學(xué)生，他不愛(ài)學(xué)習(xí)懶惰認(rèn)性，喜歡捉弄小動(dòng)物，爸爸（津嘉山正種 配音）媽媽?zhuān)ǔ靥锊?配音）對(duì)他都失去了信心。因得罪了小妖精（槐柳二 配音），尼爾斯被妖精施魔法變成了個(gè)小人。常被他欺負(fù)的動(dòng)物們都很高興，它們紛紛對(duì)尼爾斯進(jìn)行報(bào)復(fù)。他家常被遷徙的雁群嘲笑的鵝莫爾典經(jīng)過(guò)反復(fù)練習(xí)飛上了天空，尼爾斯和跟他一起變小的卡駱駝（山崎唯 配音），騎著它飛上了天空，跟著大雁群去旅行了。他神奇地能聽(tīng)懂了動(dòng)物的語(yǔ)言，在湖邊他救了被狐貍襲擊的大雁，在途中又救了森林里的小松鼠，一路上尼爾斯遇到了很多危險(xiǎn)也在成長(zhǎng)中磨練了自己，并從各種動(dòng)物身上學(xué)習(xí)它們的優(yōu)點(diǎn)，也幫助了很多動(dòng)物。尼爾斯騎著鵝莫爾典在慢長(zhǎng)的旅途中，還會(huì)碰到哪些困難和危險(xiǎn)呢？他能否實(shí)現(xiàn)他的愿望變大回到家中變成一個(gè)好孩子嗎？