故事發(fā)生在戰(zhàn)國(guó)時(shí)代，普通人家出身的男孩豬名寺亂太郎祖輩曾是忍者，在父親的勸說(shuō)下，他離開(kāi)家鄉(xiāng)攝津，進(jìn)入當(dāng)時(shí)一流的忍者學(xué)園學(xué)習(xí)。在學(xué)校，他認(rèn)識(shí)了與之同齡的新兵衛(wèi)和霧丸。新兵衛(wèi)是一個(gè)出身富商家庭的小胖子，為人迷迷糊糊，對(duì)吃尤為感興趣；霧丸則是身世貧苦的孤兒，為人精明，貪財(cái)吝嗇。這三個(gè)性格迥異卻的小家伙成為好朋友，他們最大的共同點(diǎn)就是經(jīng)常因?yàn)榭荚嚥患案袷艿教幜P。當(dāng)然，以校長(zhǎng)大川平次渦正為首的老師們也都是性格古怪且鮮明的爆笑人物，亂太郎他們和周圍的同學(xué)、老師一起上演了連番搞笑、有趣的精彩好戲……
　　本片根據(jù)漫畫(huà)家尼子騒兵衛(wèi)原著《落第忍者亂太郎》改編，改編成動(dòng)畫(huà)時(shí)，因NHK電視臺(tái)的禁忌而將“落第”二字去掉。